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Información

El diseño de nuevos fármacos, así como de la predicción de sus propiedades fisicoquímicas y parámetros farmacológicos son de gran importancia a nivel investigación e industrial en el área de la salud a causa de las distintas enfermedades con alto índice de mortalidad a nivel mundial. Es por ello, que en el curso se presenta la perspectiva general de la investigación y las diferentes aplicaciones de las técnicas de modelado molecular, sus conceptos principales, metodologías disponibles, herramientas gratuitas y una revisión general de las diferentes aplicaciones para el desarrollo de nuevos fármacos y el estudio de las interacciones entre ligando-macromolécula, macromolécula-macromolécula.  

Curso dirigido a estudiantes de nivel licenciatura del área Químico-Biológicas, licenciatura en Farmacia, Química, Física, así como estudiantes de posgrado maestría y doctorado relacionados con el área.

Duracion: 10 horas en 4 días 

Fechas: 18, 19, 25 y 26 de septiembre 2021.

Horarios: 5:00 PM a 7:30 PM (Hora CDMX).

Conocimientos mínimos: Química general, termodinámica, bioquímica,  grupos funcionales, conocimientos básicos de computación.

Programas a utilizar (no es necesario tenerlo instalado): Pymol, VMD, Autodock, Gaussian, Chimera.

Materiales requeridos: PC o laptop, sistema operativo Windows de preferencia. 

Plataforma: Google Meet. Grabación de las sesiones en vivo.

Capacitador: Elmer Joel Millán Casarrubias, Maestro en ciencias con especialidad en farmacología.

Candidato a doctorado en ciencias en la especialidad de nanociencias y nanotecnología.

Contenido del curso

1. Introducción al modelado molecular 
   1.1 Definición de conceptos básicos


2. Relaciones estructura-propiedad


3. Metodologías de acoplado molecular
   3.1 Docking proteína-ligando
   3.2 Docking proteína-proteína


4. Bases de datos
    4.1 Genbank
    4.2 Uniprot
    4.3 Protein Data Bank


5. Identificación y elección del sitio blanco

6. Métodos de optimización para ligando
    6.1 Minimización de la energía
    6.2 Método Hartree Fock
    6.3 Método del Funcional de la Densidad (DFT)
    6.4 Métodos semi-empíricos 

7. Predicción teórica de propiedades químico-biológicas para los ligandos


8. Interacciones biomoleculares y termodinámica
    8.1 Cálculo de propiedades  
    8.2 Cálculo de la energía de asociación
    8.3 Simulación de un complejo ligando-proteína 
   8.4 Métodos de simulación 


9. Visualizadores de estructuras
    9.1 Pymol
    9.2 VMD
    9.3 Chimera
    9.4 Autodock


10. Interpretación y análisis de resultados

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