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Docking molecular y cribado virtual

Información del curso

En la actualidad el diseño de nuevos fármacos, así como de la predicción de sus propiedades fisicoquímicas y parámetros farmacológicos (farmacodinamia, farmacocinética) son de gran importancia en la investigación e industrial del área de la salud, a causa de las distintas enfermedades con alto índice de mortalidad a nivel mundial. Es por ello, que en el curso se presenta la perspectiva general de la investigación y las diferentes aplicaciones de las técnicas de acoplamiento molecular, sus conceptos principales, metodologías disponibles, herramientas gratuitas y una revisión general de las diferentes aplicaciones para el desarrollo de nuevos fármacos y el estudio de las interacciones entre ligando-receptor.

Número de horas / días por semana: 10 horas / 2 días.

Fechas: 4 y 5 de junio de 2021.

Horario: viernes de 17:00 a 20:00 horas y sábado 8:00 a 15:00 horas.

Conocimientos mínimos: Niveles estructurales de las proteínas, relación ligando-enzima y ligando-receptor, computación básica 

Programas a utilizar (no es necesario tenerlo instalado): Autodock4, VINA, LigPlot, DiscoveryStudio, PoseView y Raccoon.

Materiales requeridos: Computadora con acceso a internet y sistema operativo Windows de preferencia.

Plataforma: Google Meet. Grabación de las sesiones en vivo.

Capacitador: Dr. Andrés Reyes Chaparro

Contenido del curso

1. Introducción al acoplamiento molecular 
   1.1 Definición de conceptos básicos

2. Bases de datos
   2.1 Protein Data Bank 
   2.2 PubChem
   2.3 ZINC
   2.4 ChEMBL
   2.5 DrugBank

3. Identificación y elección del sitio blanco

4. Métodos de optimización para ligando y proteína

5. Acoplamiento molecular
   5.1 Con Autodock4 y AutodockTools

6. Análisis de interacciones

7. Introducción al cribado virtual 
   7.1 Cribado con Autodock VINAy Perl
   7.2 Análisis de resultados

8.Obtención de imágenes de calidad para publicaciones y reportes 

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