Diseño in silico de primers

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Información

Este curso aborda las características principales que debe cumplir un primer para garantizar el éxito de la reacción. Se analizarán las herramientas bioinformáticas (in silico) más utilizadas, que nos permitirán diseñar y predecir el comportamiento del primer durante la reacción de PCR, antes de que se realice el ensamblaje, según las necesidades y especificaciones de cada secuencia. 

Curso dirigido a estudiantes y profesionales que se desenvuelvan en las diferentes áreas que forman parte de las biociencias: biotecnología, biología, bioquímica, microbiología, medicina, agronomía y carreras afines.

Horas totales / días: 6 horas / 3 días. 

Fechas: 21, 22 y 28 de agosto.

Horarios: 9:00 AM a 11:00 AM. (Hora CDMX).

Conocimientos mínimos: Conocimientos básicos de biología molecular y química. Conocimientos básicos de computación.

Materiales requeridos: Computador básico actualizado con conexión a internet (Windows, Mac, Linux). Navegador de internet de su elección (Explorer, Chrome, Mozilla, Safari). Editor de texto (Word, Google Docs o afines). Lector de PDFs (Adobe reader, PDF Reader o afines).

Plataforma: Google Meet. Grabación de las sesiones en vivo.

Capacitador: Ma. en C. Fátima Elizabeth Murillo González. Candidata a doctor en la especialidad de Biología Celular en CINVESTAV-IPN.

Contenido del curso

1. Introducción al diseño de primers.
   1.1 Parámetros básicos para tomar en cuenta para el diseño de primers.
   1.2 Termodinámica de Primers.

 

2. Diseño in silico de primers.
   2.1 Bases de datos (NCBI) para la obtención de secuencias.
   2.2 Manejo de softwares para el diseño de primers.


3. Evaluación in silico de la efectividad de los primers.   

   3.1 Cálculo de la temperatura de alineamiento (Tm).   

   3.2 Formación de estructuras secundarias.

4. Proceso de solicitud, recepción y reconstitución de primers.

 

5. Evaluación experimental de la efectividad de los primers.
   5.1 Fundamentos de la PCR
   5.2 Diseño de la PCR.
   5.3 Comprobación del producto de PCR.

 

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