Diseño in silico de

Primers

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Información

Este curso aborda las características principales que debe cumplir un primer o cebador para garantizar el éxito de la reacción. Se analizarán las herramientas bioinformáticas (in silico) más utilizadas, que nos permitirán diseñar y predecir el comportamiento del primer durante la reacción de PCR, antes de que se realice el ensamblaje, según las necesidades y especificaciones de cada secuencia. 

Curso dirigido a estudiantes y profesionales que se desenvuelvan en las diferentes áreas que forman parte de las biociencias: biotecnología, biología, bioquímica, microbiología, medicina, agronomía y carreras afines.

Horas totales: 6 horas en 2 sesiones. 

Fechas: 12 y 13 de febrero del 2022.

Horarios: 10:00 AM a 1:00 PM. Hora de la Ciudad de México.

Conocimientos mínimos: Conocimientos básicos de biología molecular y química. Conocimientos básicos de computación.

Materiales requeridos: Computador básico actualizado con conexión a internet (Windows, Mac, Linux). Navegador de internet de su elección (Explorer, Chrome, Mozilla, Safari). Editor de texto (Word, Google Docs o afines). Lector de PDFs (Adobe reader, PDF Reader o afines).

Plataforma: Google Meet. Grabación de las sesiones en vivo.

Capacitador: Ma. en C. Fátima Elizabeth Murillo González. Candidata a doctor en la especialidad de Biología Celular en CINVESTAV-IPN.

Contenido del curso

1. Introducción a la PCR
   1.1 Variedades de la PCR

 

2. Introducción al diseño de primers
   2.1 Características de los primers.
   2.2 Parámetros básicos para el diseño de primers.

 

3. Diseño de primers
   3.1 Primers para PCR punto final y PCR cuantitativa qPCR.
   3.2 Primers para ligación por restricción.
   3.3 Primers para ligación de Gibson.

4. Diseño in silico de primers.
   4.1 Conocimiento y empleo de diversos softwares para el diseño de primers.
   4.2 Evaluación de temperatura de alineamiento y formación de estructuras secundarias.

 

5. Proceso de solicitud, recepción y reconstitución de primers.
   5.1 Primers modificados (bases especiales, bases fluorescentes).
   5.2 Evaluación experimental de la calidad de los primers.

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