ANÁLISIS FILOGENÉTICOS

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Los análisis filogenéticos son una herramienta imprescindible en el área de la evolución biológica y sistemática, últimamente utilizada actualmente, en el área de evolución molecular. El área de aplicación de los análisis filogenéticos basados en secuencias es sumamente diversa, desde el estudio de los patrones de evolución de genes, proteínas y especies, hasta la identificación de nuevas variantes y cepas virales y bacterianas, respectivamente.

Curso dirigido a Estudiantes de nivel licenciatura del área Químico-Biológicas. Estudiantes de maestría y doctorado relacionados con el área.

Duración: 12 horas en 4 sesiones.

Fechas: 18, 25 de junio y 2, 9 de julio del 2022

Horarios: 9:00 AM a 12:00 PM (Hora CDMX).. Hora de la Ciudad de México.

Conocimientos mínimos: Conocer términos básicos de bioquímica, biología, química.

Materiales requeridos: Computadora con acceso a internet y sistema operativo Windows de preferencia.

Plataforma: Google Meet. Grabación de las sesiones en vivo.

Capacitador: M. en C. Juan Manuel Quijano Barraza.

Candidata a doctor en Ciencias Quimico-biológicas en la Escuela Nacional de Ciencias Biológicas del Instituto Politécnico Nacional.

Contenido del curso

1. Introducción a la evolución molecular y filogenética
   1.1. Evolución molecular
   1.2. Filogenia 
   1.3. Homología
   1.4. Marcadores moleculares 
   1.5. Inferencia filogenética y métodos de reconstrucción

2. Análisis filogenéticos basados en secuencias
   2.1. Homología en secuencias de ADN y proteínas
   2.2. Obtención y alineamiento de secuencias 
   2.3. Modelos evolutivos y criterios de selección
   2.4. Métodos de distancia
   2.5. Métodos basados en probabilidad

3. Software para el procesamiento de datos y reconstrucción filogenética
   3.1. Software de alineamiento y edición (Seaview, Clustal, MUSCLE, CLC sequence viewer)
   3.2. Software para estimación de parámetros (JmodelTest, ProtTest)
   3.3. Software para la construcción de árboles filogenéticos (PhyML, BEAST)
   3.4. Software para visualización de árboles filogenéticos (FigTree)
   3.5. Software para la edición de figuras (InkScape)

4. Práctica de reconstrucción filogenética

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