BIOINFORMÁTICA

para la investigación

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En la actualidad el uso de herramientas bioinformáticas para la interpretación y manejo de los datos en las principales disciplinas como la biología, medicina, genómica, proteómica y química es de gran importancia. En este sentido, integración de los sistemas computacionales y las ciencias de la vida a través del manejo de bases de datos es uno de los principales objetivos de la bioinformática. Sus conocimientos le permitirán analizar secuencias de ADN y secuencias de proteínas, utilizando distintos tipos de algoritmos.

Curso dirigido a estudiantes de nivel licenciatura del área Químico-Biológicas (IBQ, QI, QFB, QBP, etc), licenciatura en Farmacia, Química, Física, así como estudiantes de posgrado maestría y doctorado e investigadores relacionados con el área.

Duración: 10 horas en 4 sesiones.

Fechas: 30, 31 de julio y 6, 7 de agosto del 2022.

Horarios: 10:00 AM a 12:30 PM. Hora de la Ciudad de México.

Conocimientos mínimos: Conocer términos básicos de bioquímica, biología, química.

Programas a utilizar: (no es necesario tenerlo instalado): Bioedit, Mega, Jalview.

Materiales requeridos: Computadora con acceso a internet y sistema operativo Windows de preferencia.

Plataforma: Google Meet. Grabación de las sesiones en vivo.

Capacitador: M. en C. Fátima Elizabeth Murillo González.

Candidata a doctor en la especialidad de Biología Celular en CINVESTAV-IPN.

Contenido del curso

1. Introducción a la Bioinformática
   1.1 Definición, antecedentes y aplicaciones de la Bioinformática

 

2. Almacenamiento y obtención de secuencias
   2.1 Tipos de formato de texto de secuencias (FASTA, QUAL, FASTQ y GenBank).
   2.2 Obtención de secuencias desde bases de datos.

 

3. Edición de secuencias
   3.1 Softwares para la visualización de cromatogramas.
   3.2 Edición de secuencias: control de calidad y corrección de errores (Chromas, BioEdit y 4peaks).
   3.3 Ensamblaje de secuencias con Ugene (Ej. secuenciación tipo Sanger).

 

4. Herramientas de análisis en Bioinformática
   4.1 Alineamientos de secuencias: alineamientos locales y globales.
   4.2 Algoritmo de búsqueda de secuencias BLAST.
   4.3 Alineamiento múltiple de secuencias (CLUSTAL y MUSCLE).
      4.3.1 Homología de secuencias
      4.3.2 Identificación de secuencias conservadas.
      4.3.3 Construcción filogenética y visualización de árboles filogenéticos (Phylodendron, Phylo.io, IcyTree).

 

5. Bioinformática aplicada a genómica estructural: anotación de genomas
   5.1 Predicción de genes procariotas con ORF finder.
   5.2 Predicción de genes eucariotas con GenScan).

 

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